文章信息
- 宫兆宁, 赵雅莉, 赵文吉, 林川, 崔天翔
- GONG Zhaoning, ZHAO Yali, ZHAO Wenji, LIN Chuan, CUI Tianxiang
- 基于光谱指数的植物叶片叶绿素含量的估算模型
- Estimation model for plant leaf chlorophyll content based on the spectral index content
- 生态学报, 2013, 34(20): 5736-5745
- Acta Ecologica Sinica, 2013, 34(20): 5736-5745
- http://dx.doi.org/10.5846/stxb201301250160
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文章历史
- 收稿日期:2013-1-25
- 网络出版日期:2014-3-11
2. 三维信息获取与应用教育部重点实验室, 北京 100048;
3. 资源环境与地理信息系统北京市重点实验室, 北京 100048;
4. 北京市城市环境过程与数字模拟国家重点实验室培育基地, 北京 100048
2. Key Laboratory of 3D Information Acquisition and Application of Ministry of Education, Beijing 100048, China;
3. Key Laboratory of Resources Environment and GIS of Beijing Municipal, Beijing 100048, China;
4. Base of the State Laboratory of Urban Environmental Processes and Digital Modeling, Beijing 100048, China
湿地植被是湿地生态系统的重要组成成分,在维持生态系统结构和功能方面起到十分重要的作用,因此成为湿地生态系统监测的重点[1]。选择不同时空尺度上的典型湿地植被的生化参数进行系统性研究,不仅可以及时掌握湿地生态系统的动态变化,为湿地生态系统价值评价提供重要参数[2],同时还可作为湿地生态系统基本生态价位的划分标准,并为湿地生态系统的管理、恢复以及重建提供科学依据。
叶绿素含量与植被的光合能力、发育阶段具有较好的相关性,它通常是光合作用能力和植被发育阶段(特别是衰老阶段)的指示器[3],因此叶绿素含量是作为监测湿地植被生长健康状况的重要标志之一。近些年发展起来的高光谱遥感技术,由于其具有波段多且窄的特点,能直接对植被进行微弱光谱差异的定量分析,在植被遥感研究与应用中表现出强大优势,同时也为植被生理参数的定量化诊断提供了简便、快速、有效、非破坏性的数据采集和处理方法[4, 5]。植被叶片反射光谱在可见光范围受植被叶绿素的强烈吸收影响,反射率较低;在近红外区域则受叶片内部结构等影响,呈现高反射特征[6]。国内外学者开展了许多基于作物叶片反射特征进行叶绿素浓度或含量预测研究[7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21]。许多研究表明,植被光谱“红边”对植被生长状况反映敏感。其定义为植物反射光谱曲线中斜率最大的点,位于波长690—720 nm之间[10],实验室实验已经证实了红边拐点的波长位置和叶片样品的叶绿素浓度具有正相关[11],Curran等人发现红边拐点位置与沼泽松枝条的叶绿素浓度有正相关[12]。杜华强等发现:红边位置、红边平均反射率、红边位置附近平均反射率、红边斜率、红边面积、红谷吸收深度、绿峰反射高度、红边归一化植被指数、红边植被胁迫指数等9个马尾松反射光谱特征参数均与叶绿素含量间存在指数函数关系[13]。
目前应用高光谱遥感技术在监测和诊断植物叶绿素含量方面已有一些成效,但是研究方法单一、不够全面,并且在湿地植物叶绿素含量估算中的应用研究很少见。因此,本文主要以北京野鸭湖湿地自然保护区内的湿地植物为研究对象。利用室内光谱仪以加载叶片夹持器测得的植物叶片高光谱反射率数据及同步测定的叶绿素含量,通过已有的基于高光谱反射率数据的“三边”参数以及初步构造的差值和归一化光谱指数模型,分别分析其与叶绿素含量的相关性,比较叶绿素含量的估算效果,以期确立野鸭湖湿地植被叶绿素含量的监测模型,进而在认识湿地植被的恢复速率和生产力状况方面做一些探索。
1 材料与方法 1.1 研究区概况野鸭湖湿地自然保护区是北京唯一的湿地鸟类自然保护区,也是北京最大的湿地自然保护区。位于北京市延庆县西北部的延庆镇、康庄镇、张山营镇和延庆农场交界处,地理位置处于东经115°46′16″—115°59′48″,北纬40°22′04″—40°30 ′31″之间,北、东、南三面环山,西南临官厅水库,是官厅水库延庆辖区及环湖海拔479m以下淹没区及滩涂组成的次生湿地,保护区总面积为6873hm2,湿地面积达3939hm2(图 1)。保护区地处延怀盆地之延庆部分,属于北京北山隆起区块中的延庆昌平活动断裂区,是北京唯一的山间盆地,地势平坦,四周高,中间低,海拔高度480—800m,妫水河自东北向西南贯穿。该区域属北温带大陆性季风气候,四季变化较为明显,气候凉爽,昼夜温差较大,降水主要集中在夏季的6—8月份,其中降雨高峰期为7月下旬至8月上旬[22]。区域内湿地植被资源丰富,共有湿地植物71科213属357种(高等植物)。同时,丰富的湿地植被资源也为水禽和各类鸟类提供了优越的觅食、隐藏及繁殖场所,是候鸟南北迁徙的主要信道,也是珍稀水禽的重要停歇地,具有极其重要的生物多样性保护价值[23]。
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图 1 研究区地理位置图 Fig. 1 Location map of study area |
湿地环境较为复杂,有的区域因为地形地貌的限制难以进入,同时研究区内湿地植被类型众多,因此在采样过程中无法覆盖全部区域以及植被类型,所以在进行野外光谱数据采集之前,首先要对采样区域及植被类型进行选择和确定。本次研究选定的采样区域如图 1所示,图 1中1、2、3三个区域内沟岔众多、滩涂面积较大,湿地植被类型丰富,具有一定的典型性和代表性;区域4由人工建造的围堤所包围,围堤内湿地植被生长状况良好,面积较大,也具有一定的典型性与代表性。上述区域内路面情况较好,方便到达,地势平坦,水深较浅,利于开展光谱数据以及植被样本的采集工作。采样区域选定后,结合研究目的和采样区域内湿地植物的类型、长势、数量以及分布特点,选择样区内的典型湿地植被进行采样,选定的典型植物有芦苇、香蒲、三叶鬼针草、刺儿菜、小叶杨。
1.3 光谱数据的获取和预处理野外植物叶片光谱的测定采用采用美国ASD- Field Spec 3光谱仪加载的手持叶夹式叶片光谱探测器进行,这种探测器内置石英卤化灯,光源稳定;测量时叶片置于叶片夹的叶室中,然后夹紧叶片,保证叶片水平且被探测面积相同,以消除背景反射、叶片表面弯曲造成的光谱波动及叶片内部变异造成的影响,每组数据采集前均进行标准白板校正。光谱采样的波长范围为350—2500nm,其中350—1000nm和1000—2500nm的光谱采样间隔分别为1.4nm和2nm,光谱分辨率分别为3nm和10nm,数据采样间隔为1nm,光纤前视场角为25°。对测定的植物叶片进行标识,并注明编号。
光谱数据由于受到仪器以及目标地物本身光谱特性等多种因素的影响,获取的光谱数据中不仅包含地物光谱信息,而且还包含噪声信息,通过光谱数据的预处理可以消除噪声并且突出地物光谱的某些细微差别。光谱数据的预处理主要包括光谱平滑去噪和光谱曲线均值处理两个部分。
(1)光谱平滑去噪 由于光谱仪波段间对能量响应上的差异,使得光谱曲线总存在一些噪声,为了得到平稳与概略的变化,需要平滑波形,以去除包含在信号内的少量噪声。本次研究中选用前后9个波段的平均值作为滤波后的光谱值,其函数式为:
(2)光谱曲线均值处理 由于每个样点每次采集50条光谱曲线,所以对每10条曲线进行一次均值运算,均值处理后的5条光谱曲线作为每个样点的最终光谱曲线,图 2为本研究中获取的典型湿地植物叶片光谱曲线。5种植物类型叶片光谱曲线的主要差异主要存在于叶绿素强吸收的蓝、红光区域和水吸收的中红外区域。在350—700nm区间主要由叶片的各种色素控制叶片的反射率,其中芦苇和小叶杨的反射率最高;在700—1250nm区间由细胞结构控制的叶片反射率,香蒲的反射率最高,其次是小叶杨;在1250—2300nm区间由叶片含水量控制的叶片反射率,其中芦苇的反射率最高,小叶杨次之;总的来说芦苇、香蒲和小叶杨的光谱反射率较高而刺儿菜的反射率最低。
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图 2 典型湿地植物叶片光谱曲线 Fig. 2 Spectral curves of typical wetland plant vanes |
叶绿素含量测量采用测量光谱的对应叶片中间部位的叶脉两侧,剪取0.30g叶片呈细丝状于试管中,以百分之一精度电子天平称量,加入试剂(丙酮∶无水乙醇=1∶1)25mL,闭光提取24h,用DR 2008 Spectrophotomete分光光度计测646和663nm处的光密度。计算叶绿素浓度:
式中,A663、A646分别代表在663,646波段处的光密度值,浓度单位mg/L,含量单位mg/g。水中的香蒲、岸边的芦苇、近岸的三叶鬼针草、远岸的刺儿菜以及小叶杨在内的5种野鸭湖湿地常见植物类型及对应的光谱曲线参见图 3。从图中可以发现叶绿素含量最高的是芦苇,其对应的光谱曲线中在绿峰位置的光谱反射率也是最高的;而叶绿素含量较低的三叶鬼针草相对应的光谱曲线反射率也最低。其中,叶绿素含量相对含量较高的是芦苇、香蒲和三叶鬼针草,是野鸭湖湿地的典型湿地植物;而叶绿素含量较低的小叶杨是中生植物[23]。叶绿素含量可以表征植物的营养状况,同时也是植物受胁迫及外界环境因子干扰状态下的指示器,可以反映植物的生产能力的高低。本研究结果表明在野鸭湖湿地保护区中,其典型的湿生植物的叶绿素含量相对较高,具有较高的生产力。
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图 3 野鸭湖湿地典型植物类型叶绿素含量及可见光波段处光谱曲线 Fig. 3 chlorophyll content of typical plants in Wild Duck Lake wetlands and the spectral curve at visible band |
以实测高光谱数据和叶绿素含量数据为基础,首先选择植被生理生化参数反演模型常用的三边参数,构建叶绿素高光谱反演模型。对选取的典型湿地植物叶片的三边参数(表 1)与叶绿素含量进行相关分析,选择与叶绿素含量显著相关的光谱参数,并通过逐步回归的分析方法确定监测典型湿地植被的最佳光谱参数,建立估算模型。
类型Type | “三边”参数Trilateral parameters | 定义Definition |
基于光谱位置的变量 | Dr | 红边(680—760nm)内最大一阶微分值 |
Characteristic variable based | WP_r | Dr对应的波长即红边位置 |
on spectral area | Db | 蓝边(490—530nm)内最大一阶微分值 |
WP_b | Db对应的波长即蓝边位置 | |
Dy | 黄边(560—640nm)内最大一阶微分值 | |
WP_y | Dy对应的波长即黄边位置 | |
基于光谱面积的变量 | SDr | 红边内一阶微分的总和 |
Characteristic variable based | SDb | 蓝边内一阶微分的总和 |
on spectral area | SDy | 黄边内一阶微分的总和 |
基于植被指数形式的变量 | SDr/SDb | 红边内一阶微分总和与蓝边内一阶微分总和的比值 |
Characteristic variable based | SDr/SDy | 红边内一阶微分总和与黄边内一阶微分总和的比值 |
on vegetation index | (SDr-SDb)/(SDr+SDb) | 红边内一阶微分总和与蓝边内一阶微分总和的归一化值 |
(SDr-SDy)/(SDr+SDy) | 红边内一阶微分总和与黄边内一阶微分总和的归一化值 |
其次,为了使植被反射信息最大化、外部因素影响最小化[24],初步构建了比值植被指数和归一化差值光谱指数。在光谱重采样的基础上(5nm),本研究初步构造了在 400—2350 nm波段范围内由任意两个波段反射率组合而成的所有比值 (6)、 归一化差值 (7),使用MATLAB编程得到它们与植物叶绿素含量的决定系数矩阵图,分析它们与叶绿素含量的关系:
式中, SR为比值光谱指数,ND为归一化光谱指数,Rn为波段n的反射率。采用交叉检验(Cross Validation,CV)中的K-fold Cross Validation方法(简称K-CV)对估算模型进行测试和检验。K-CV是将原始数据分成K组(通常是均分),然后将每个子集数据分别做一次验证集,其余K-1组子集数据作为训练集,得到K个模型,最后用这K个模型最终验证集的分类准确率平均数作为此K-CV下分类器的性能指标。本次研究中所使用的交叉检验方法为3K-CV,即将样本数据随机分成3组,每组样点数量近似相等,选取其中两组作为训练样本建立估算模型,剩余一组进行验证,如此循环3次。估算模型的准确性和适用性采用通用的均方根误差(RMSE)、相对误差(RE)和决定系数(R2)3个指标进行评定,并绘制预测值与实测值之间的1∶1关系图,以直观的展示估算模型的拟合度和可靠性。其中3K-CV取3次验证的判定系数的平均值作为该模型的精度。
2 结果与分析 2.1 基于“三边”参数的植物叶片叶绿素含量估算模型“三边”参数能够较好的反映绿色植被的光谱特征,对叶绿素含量的变化较为敏感,有学者指出,红边位置、红边平均反射率、红边位置附近平均反射率、红边斜率、红边面积等反射光谱特征参数均与叶绿素含量间存在指数函数关系。因此,“三边”参数可以作为叶绿素含量的诊断特征。利用与“三边”参数有关的13个光谱特征变量与叶片的叶绿素含量进行相关性分析。
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图 4 绿素含量与“三边”参数的相关系数 Fig. 4 Correlation coefficient between chlorophyll content and trilateral parameters 1:Dr,2:WP_r,3:Db,4:WP_b,5:Dy,6:WP_y,7:SDr,8:SDb,9:SDy,10:SDr/SDb,11:SDr/SDy,12:(SDr-SDb)/(SDr+SDb),13:(SDr-SDy)/(SDr+SDy) |
从表 2可以看出,基于光谱位置的变量中,在红边位置(WP_r)与叶绿素含量呈现最大正相关0.867。基于光谱面积的变量中,在黄边面积(SDy)呈现了最大正相关0.711,红边面积(SDr)与叶绿素含量不相关,相关系数为 0.054。基于植被指数形式的变量中,红边面积(SDr)与黄边面积(SDy)构建的归一化植被指数的相关性最强,相关系数达到-0.581,呈极显著的负相关。
类型Type | “三边”参数Trilateral parameters | 相关系数Correlation coefficient |
*表示在0.05水平上显著;**表示在0.01水平上极显著,样本n=102 | ||
基于光谱位置的变量 | Dr | -0.638** |
Characteristic variable | WP_r | 0.867** |
based on spectral area | Db | -0.769** |
WP_b | -0.547** | |
Dy | -0.116 | |
WP_y | -0.133 | |
基于光谱面积的变量 | SDr | 0.054 |
Characteristic variable | SDb | -0.614** |
based on spectral area | SDy | 0.711** |
基于植被指数形式的变量 | SDr/SDb | 0.499** |
Characteristic variable | SDr/SDy | -0.515** |
based on vegetation index | (SDr-SDb)/(SDr+SDb) | 0.573** |
(SDr-SDy)/(SDr+SDy) | -0.581** |
植物叶片叶绿素含量与“三边”参数具有较好的相关性,说明采用这些光谱特征变量对野鸭湖湿地植被叶绿素含量进行估算具有较高的可行性,本文中将采用交叉检验的方法(3K-CV)进行估算模型的建立和验证。选取相关系数最大的光谱特征参数为自变量(红边位置WP_r),以叶绿素含量为因变量,进行单变量线性回归分析,建立叶绿素含量估算模型。
光谱特征参数(x)Spectral parameters (x) | 回归方程Regression equation | R2 |
样本n=68 | ||
红边位置(WP_r) | y=0.113x-78.74 | 0.751 |
建立估算模型后,为了检验估算模型的可靠性和适用性,采用通用的均方根误差(RMSE)、相对误差(RE)和决定系数(R2)3个指标对估算模型进行评定(表 4),并绘制预测值与实测值之间的1 ∶ 1关系图(图 5),以直观的展示估算模型的拟合度和可靠性。
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图 5 叶绿素含量与最优“三边”参数回归模型 Fig. 5 Regression model between chlorophyll content and best trilateral parameters |
回归方程 Regression equation | R2(Determination Coefficient) | RMSE(Root Mean Square Error) | RE%(Relative Error) |
样本n=34 | |||
y=0.866x+0.353 | 0.802 | 0.27 | 6.10 |
检验结果表明,基于红边位置(WP_r)光谱特征参数建立的叶绿素含量估算模型,取得了较好的测试效果,检验拟合方程的决定系数(R2)达到了0.8以上,均方根误差(RMSE)和相对误差(RE)均较小,具有较高的拟合精度和较小的相对误差。植被叶绿素含量估算模型具有最大的决定系数(R2= 0.802)、最小的均方根误差(RMSE = 0.27)和最小的相对误差(RE =6.1%),预测精度达到了93.9%。
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图 6 叶绿素含量实测值和预测值比较(“三边”参数) Fig. 6 Comparison between the measured value and the predicted value(trilateral parameters) |
计算光谱反射率组成的比值和归一化光谱指数与叶绿素含量的决定系数,结果参见图 7,图中红色代表相关系数最高,蓝色代表相关系数最低。结果显示归一化组合和比值组合之间具有一定的相似性,相关性达到P<0. 01 显著水平,总体相关性比较高,归一化指数优于比值指数,相关系数高的比值组合其归一化组合表现较好。较好的组合均为550—700nm与700—1400nm以及550—700nm与1600—1900nm。与叶绿素含量相关性最好的指数分别是SR(565nm,740nm)和ND(565nm,735nm)。利用最优的光谱指数ND(565,735)与叶绿素含量建立线性回归模型,并对模型进行交叉验证,交叉验证的决定系数和均方根误差如表 6所示。
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图 7 光谱指数与叶绿素含量的决定系数图 Fig. 7 The coefficient of determination between the spectral index and chlorophyll content |
光谱特征参数(x)Spectral parameters (x) | 回归方程Regression equation | R2 |
样本n=20 | ||
ND(565,735) | y=20.89x-18.45 | 0.824 |
回归方程 Regression equation | R2(Determination Coefficient) | RMSE(Root Mean Square Error) | RE%(Relative Error) |
样本n=9 | |||
y=0.688x +0.658 | 0.718 | 0.29 | 9.30 |
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图 8 叶绿素含量与最优光谱指数回归模型 Fig. 8 Regression model between chlorophyll content and best spectral index |
检验结果表明,ND(565,735)光谱指数的叶绿素含量估算模型,检验拟合方程的决定系数(R2)达到了0.8以上,均方根误差(RMSE)和相对误差(RE)均较小,具有较高的拟合精度和较小的相对误差。植被叶绿素含量估算模型具有最大的决定系数(R2= 0.72)、最小的均方根误差(RMSE = 0.29)和最小的相对误差(RE =9.3%),预测精度达到了90.7%。
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图 9 叶绿素含量实测值和预测值比较(ND(565,735)) Fig. 9 Comparison between the measured value and the predicted value(ND(565,735)) |
本次研究采用室内光谱仪加载叶片夹持器测得的野鸭湖湿地植物叶片高光谱反射率数据及同步测定的叶绿素含量,利用相关分析与逐步回归分析的统计学分析方法,通过对选取的典型湿地植物各项光谱特征参数进行系统分析,确定了监测典型湿地植被的最佳光谱特征参数,建立了湿地植物叶片叶绿素含量估算模型,并采用交叉检验中的3K-CV方法对估算模型进行了测试和检验。结论如下:
(1)植物叶片叶绿素含量选取的光谱特征参数整体上相关性较强,与“三边”参数大多都呈极显著相关,相关系数最大达到0.867;SR和ND光谱指数与叶绿素含量的决定系数,总体相关性比较高,与叶绿素含量相关性最好的指数分别是SR(565nm,740nm)和ND(565nm,735nm),相关系数分别达到0.8024、0.8244。说明采用这些光谱特征变量对植被叶绿素含量进行估算具有较高的可行性。
(2)通过选取相关性最佳的光谱特征参数,分别基于“三边”参数和光谱植被指数构建了植物叶片叶绿素估算模型。其中,基于红边位置(WP_r)光谱特征参数和ND(565nm,735nm)光谱指数建立的叶绿素含量估算模型,取得了较好的测试效果,检验拟合方程的决定系数(R2)达到了0. 8以上,估算模型分别为y=0.113x-78.74,y=5.5762x+4.4828。
(3)本次研究的估算模型采用交叉检验中的3K-CV方法进行测试和检验,3K-CV方法可以充分利用样本数据,有效的避免过学习以及欠学习状态的发生,得到的结果也更具有说服力。以上两方面较大的增强了模型的可靠性和普适性。通过测试和检验,植物叶绿素含量估算模型均取得了较为理想的预测精度,预测精度的分别为93.9%及90.07%,为遥感技术在野鸭湖湿地植物含水量诊断中的实际应用提供理论依据和技术支持。
(4)本次研究采用高光谱遥感分析估算湿地植物叶绿素含量,该方法属于一种无损测试技术,是在不破坏植物体本身组织结构的前提下,利用高光谱辐射仪测得叶片叶绿素光谱反射特征变化。研究中还发现,“三边”参数与叶绿素含量拟和方程的拟合度相对高于高光谱植被指数与之建立的方程的拟合度,说明“三边”参数的光谱特征参数更适合叶绿素含量的判别。
(5) 本文基于光谱指数的叶绿素含量估算,只是分析了400—2500 nm范围内任意单波段或者两波段组合而成的比值(SD)和归一化(ND)光谱指数与叶绿素含量的关系,并且所得模型精度低于基于三边参数构建的叶绿素含量估算模型。因此,在下一步研究中,需要进一步分析多波段(三波段或者更多)组合而成的光谱指数与叶绿素含量的相关性,并且采用多元回归分析拟合方法,构建相关性更高的光谱植被指数,进一步提高估算模型的可靠性和准确性;另一方面,利用统计学方法得到的经验模型,虽然具有一定的可靠性和普适性,但是在时间域和空间域内仍然具有较大的局限性,需要利用理论基础更为严密的辐射传输模型(Prospect模型),进行叶绿素含量的估算;最后,本文只应用实测高光谱数据进行分析,无法体现宏观范围上的湿地植物叶绿素含量分布,在下一步研究中应结合星载或机载高光谱影像,达到图谱合一,充分发挥高光谱遥感技术的特点和优势。
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