生态学报  2016, Vol. 36 Issue (21): 6909-6918

文章信息

曹路, 李春瑞, 田青松, 杜建材, 王忠武, 韩冰
CAO Lu, LI Chunrui, TIAN Qingsong, DU Jiancai, WANG Zhongwu, HAN Bing.
内蒙古荒漠草原植物遗传多样性对模拟增温处理的响应
The response of genetic diversity in desert steppe plants to simulated warming in Inner Mongolia, China
生态学报[J]. 2016, 36(21): 6909-6918
Acta Ecologica Sinica[J]. 2016, 36(21): 6909-6918
http://dx.doi.org/10.5846/stxb201504220826

文章历史

收稿日期: 2015-04-22
网络出版日期: 2016-03-03
内蒙古荒漠草原植物遗传多样性对模拟增温处理的响应
曹路1,2, 李春瑞1,2, 田青松1, 杜建材1, 王忠武3, 韩冰1,2     
1. 中国农业科学院草原研究所, 呼和浩特 010018;
2. 内蒙古农业大学生命科学学院, 呼和浩特 010018;
3. 内蒙古农业大学生态与环境学院, 呼和浩特 010018
摘要: 为探究全球变暖对温带荒漠草原地上种群的遗传影响,对已经接受模拟增温处理6年的短花针茅草原4种不同生活型植物,即半灌木、多年生禾草、多年生杂类草和一年生植物,应用AFLP分子标记方法研究了其遗传多样性和遗传结构。结果显示,对照处理与增温处理下的木地肤、短花针茅、细叶葱、猪毛菜4种植物的多态位点百分率(PPB)分别为11.32%,11.32%;40.83%,39.91%;14.29%,13.10%;19.85%,19.12%。Nei's基因多样性指数(He)分别为0.0274,0.0259;0.0812,0.0899;0.0131,0.0084;0.0506,0.0456。Shannon's信息指数值(I)分别为0.0447,0.0430;0.1354,0.1466;0.0267,0.0182;0.0811,0.0733。分子方差分析(AMOVA)显示4种植物的变异主要来源于实验处理内部,木地肤为85.03%,短花针茅为66.35%,细叶葱为70.00%,猪毛菜为66.52%;增温处理间的变异分别占-2.81%,-5.47%,-3.60%,2.53%(P>0.05)。4种植物增温处理与变异程度之间在统计学上并无相关性。研究表明虽然短时间的模拟增温并不足以使4种生活型植物种群遗传多样性和遗传结构发生显著变化,但相对于3种多年生植物,一年生植物猪毛菜更容易受到增温影响。多年生和一年生植物对增温具有不同的遗传响应。
关键词: 木地肤     短花针茅     细叶葱     猪毛菜     遗传多样性     扩增片段长度多态性(AFLP)     模拟增温    
The response of genetic diversity in desert steppe plants to simulated warming in Inner Mongolia, China
CAO Lu1,2, LI Chunrui1,2, TIAN Qingsong1, DU Jiancai1, WANG Zhongwu3, HAN Bing1,2     
1. Institute of Grassland Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Hohhot 010018, China;
2. College of Life Science, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, China;
3. College of Ecology and Environmental Science, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, China
Abstract: Climate is the most important factor that determines vegetation types and the distribution of species, and, accordingly, these features are two of the most prominent indicators of climate change. Currently, scientists generally agree that climate change will inevitably lead to changes in plant community structure and function, and if this change continues, the effects will be profound and enduring. Existing research shows that simulated warming causes an increase in biomass in Deschampsia caespitosa, Carex alrofusca, and Leymus chinensis; as climates change, these constructive species and their main companion species within a Kobresia humilis meadow have experienced an advancement in their spring phenology and a delay in their autumn phenophase. In addition, the photosynthetic rate of Deschampsia caespitosa in a Northwest Sichuan alpine meadow has increased. Although the change in stomatal conductance was irregular, a significant decrease has also been observed in the sodium, potassium, and phosphorus content of leaves. However, relatively little research has been conducted on the effects of simulated warming on the genetic structure and diversity of plant populations. Against the background of global climate change, the temperatures of the Inner Mongolian desert steppe have become unevenly elevated, with average annual temperatures increasing from 8.1℃ in the 1950s to 9.0℃ in the 1990s. The present study explores the effects of global warming on the genetics of wild forage plant populations with different life forms in desert steppe habitat, in an effort to elucidate their potential to adapt to environmental change. The study site was located in the desert steppe in Siziwangqi territory of Inner Mongolia. Suspension infrared radiators were used to create a controlled warming experiment under otherwise natural field conditions. Warming began on May 3, 2006. The average soil temperature at depths of 0, 7.5, 15, 30, and 50 cm increased by 1.32, 0.92, 0.88, 0.80, and 0.74℃, respectively, after warming for 1 year compared with the average in plots not exposed to warming. For this study, changes in genetic diversity and structure were analyzed in four plant populations: (1) small half shrubs, represented by Kochia prostrata; (2) perennial grasses, represented by Stipa breviflora; (3) perennial forbs, represented by Allium tenuissimum; and (4) annuals and biennials, represented by Salsola collina). The study was conducted under simulated warming pressure and genetic analysis was performed using amplified fragment length polymorphism. The percentages of polymorphic loci in K. prostrata, S. breviflora, A. tenuissimum, and S. collina under non-warming were 11.32%, 40.83%, 14.29%, and 19.85%, whereas those under simulated warming were 11.32%, 39.91%, 13.10%, and 19.12%, respectively. The genetic diversity of the four populations measured under control and simulated warming, measured by the Shannon's information index, were as follows: K. prostrata (0.0274, 0.0259), S. breviflora (0.0812, 0.0899), Allium tenuissimum (0.0131, 0.0084), and S. collina (0.0506, 0.0456). These findings exhibited the same distributional pattern as that of Nei's genetic diversity index for K. prostrata (0.0447, 0.0430), S. breviflora (0.1354, 0.1466), Allium tenuissimum (0.0267, 0.0182), and S. collina (0.0811, 0.0733). Cluster analysis of these four species showed that known of the species reacted significantly to the warming process, and that inter-individual clusters were not significantly different. The results of an analysis of molecular variance (AMOVA) indicated that the main source of variation among the four life form populations was within-population variation: K. prostrata (85.03%), S. breviflora (66.35%), A. tenuissimum (70.00%), and S. collina (66.52%). The among-groups variation was not significant and accounted for the following percentages of variation: K. prostrata (-2.81%), S. breviflora (-5.47%), Allium tenuissimum (-3.60%), and S. collina (2.53%). No statistically significant correlation was found between simulated warming and genetic differentiation. This study shows that a short period of simulated warming was not sufficient to create a significant change in genetic diversity and structure for the four life form populations studied here; however, compared with the three types of perennials studied, the annual plant S. collina, is more susceptible to the effects of warming. Perennials and annuals have different genetic responses to warming. This study provides experimental evidence that can reveal the potential adaptation of plants to environmental change for different life forms of wild forage plants of the desert steppe, and will help researchers to predict forage yield and changes in forage quality.
Key words: Kochia prostrata     Stipa breviflora     Allium tenuissimum     Salsola collina     genetic diversity     AFLP     simulated warming    

气候是决定地球上植被类型及物种分布最主要的因素,而植被类型和物种分布是地球气候最鲜明的反映和标志。目前,人们普遍认同环境变化必然引起植物群落结构和功能的改变,如果这种变化持续下去,影响将是深刻而持久的[1-2]。已有的研究结果表明,增温使发草(Deschampsia caespitosa)、黑褐苔草(Carex alrofusca)、羊草(Leymus chinensis)的生物量有所增加;矮篙草草甸建群种和主要伴生种春季物候期提前,秋季物候期推迟;川西北高寒草甸植物发草(Deschampsia caespitosa)的植物光合速率增加;而对植物气孔导度变化没有规律,叶片中钠、钾、磷的含量显著下降[3-4]。李英年[5]对矮嵩草(Kobresia humilis)草甸的模拟增温研究表明,短期增温条件下群落的总生物量变化不明显,增温导致禾草生物量显著增加,而杂类草生物量显著减少。田云录[6]利用开放式主动增温系统模拟增温使冬小麦(Triticum aestivum)地上生物量、产量、有效穗数和千粒重显著提高。在贺刚[7]对烟苗的研究中,增温增加了烟苗茎粗、叶片数、干物质含量。而在模拟增温条件下有关植物种群遗传多样性和遗传结构的研究还相对较少。

在全球气候变化的背景下,中国的气候与环境也发生了显著变化[8]。近50年的观测发现,内蒙古自治区的气候也有明显变暖的趋势。根据马瑞芳的研究[9],内蒙古荒漠草原气温呈现波动式升高的规律,平均温度从20世纪50年代的8.1℃增加到90年代的9.0℃。

为了更准确地预测未来气候变化对生态系统的影响,由国家自然科学基金委资助,在我国温带典型草原进行了“全球变暖背景下白天和夜间增温对温带草原群落结构和生态系统功能的特异性影响”的增温实验。本研究所在的“内蒙古农牧科学院四子王旗实验基地”是设置在该增温样带上荒漠草原的一个观测站点,地处内蒙古乌兰察布市四子王旗王府一队。在模拟全球气候变暖的条件下,以红外线辐射器照射提高温度为手段[10],在野外自然条件中进行生态系统控制性增温实验。经测定经过增温处理1年后样地内的0cm,7.5cm,15cm,30cm 和 50cm 土壤平均温度与不增温样地相比,平均增加了1.32℃,0.92℃,0.88℃,0.80℃,0.74℃[11]。目前在该实验区内已经取得了大量的实验成果,模拟增温使荒漠草原上的短花针茅(Stipa breviflora)、冷蒿(Artemisia frigida)、无芒隐子草(Cleistogenes songorica)、木地肤(Kochia prostrata)、阿氏旋花(Convolvulus ammannii)、细叶葱(Allium tenuissimum)春季返青提前,总物候持续天数延长[11];但未能显著促进土壤呼吸[12];没有明显改变植物群落的组成[13];模拟增温和氮素添加降低荒漠草原多年生植物氮素回收效率[14]。本研究选择了4种生活型植物,分别属于灌木、半灌木(Shrubs、half shrubs)的木地肤、多年生禾草(Perennial grasses)的短花针茅、多年生杂类草(Perennial forbs)的细叶葱以及一、二年生植物(Annuals and biennials)中的猪毛菜(Salsola collina)。运用扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)方法,研究温度增加对荒漠草原4种生活型植物种群结构和遗传多样性的影响,揭示从2006年5月3日开始增温至2012年7月14日,上述4种植物种群遗传多样性对模拟增温的响应趋势,为预测野生牧草的产量、品质变化及维持生态系统稳定性,探究荒漠草原不同生活型的野生牧草对环境变化的适应潜能提供实验依据。

1 材料与方法 1.1 样地概况及增温设置

实验样地设立在内蒙古四子王旗境内的“内蒙古农牧科学院四子王旗实验基地”。地理位置为东经111°53′41 7",北纬41°46′43 6",海拔高度1456m,年均降水量约为248mm,年平均气温2—5℃,土壤为淡栗钙土。该区是处于内蒙古中部、阴山山脉以北乌兰察布高原地区的荒漠草原,是内蒙古草原的重要组成部分,也是草原区向荒漠区过渡的旱生性最强的草原生态系统。荒漠草原以其独特的种类组成、结构和功能,以及地理分布规律和独特的自然景观,成为亚洲中部的一种特殊的、十分重要的生态系统类型,具有强烈的大陆性特点。荒漠草原是草原中最旱生的类型,建群种由强旱生丛生禾草组成,经常生有大量的强旱生的小半灌木、并在群落中形成稳定的优势层片。试验区属于以短花针茅为建群种的荒漠草原的地带性植被,草地植物群落类型为短花针茅+冷篙+无芒隐子草,植被草层低矮,平均高度为8cm,且植被较稀疏,盖度为12%—18%,种类组成较贫乏,植物群落主要由20多种植物组成,建群种为短花针茅,优势种为冷篙、无芒隐子草。研究区域内植物类型划分见表 1

表 1 样地内植物生活型功能群组成 Table 1 Composition of plant life forms within the sampling plots
植物生活型 Type of plant life植物种 Plant species植物生活型 Plant life forms植物种 Plant species
灌木、半灌木 Shrubs,half shrubs冷篙Artemisia frigida、木地肤Kochia prostrata、小叶锦鸡Caragana microphylla、狭叶锦鸡儿Caragana stenophylla多年生禾草 Perennial grasses短花针茅Stipa breviflora、无芒隐子草 Cleistogenes songorica、羊草Leymus chinesis
多年生杂类草 Perennial forbs阿氏旋花Convolvulus ammannii、细叶葱 Allium tenuissimum、蒙古韭Allium mongolicum、乳白花黄芪Astragalus galactites、大包鸳尾Iris bungei Maxim、 寸草苔Carex duriuscula一、二年生植物 Annuals and biennials栉叶篙Neopallasia pectinata、猪毛菜 salsola collina、刺穗黎Chenopodium aristatum、马齿觅portulace oleracea

该样地在野外自然条件下进行生态系统控制增温实验,设置增温处理小区和对照处理小区,每处理6次重复,共12个小区。样地内增温处理小区和对照小区为随机分布,每个小区面积为3m×4m=12m2;在6个增温小区内各安装一个红外线辐射器(Infrared Radiator)进行加热,该装置通过悬挂于样地中央上方、可以散发红外线辐射的灯管来实现模拟气候变暖。红外线辐射器由美国伯利恒Kalglo电子公司(Kalglo Electronics Bethlehem,PA,USA)生产,在对照小区同样安装用于悬挂灯管的装置,但不安装灯管,用以消除增温装置对样地内植物生长环境的影响。从2006年5月3日开始加热。样地示意图见图 1

图 1 样地示意图 Fig. 1 Schematic plots 灰色阴影小区(W1—W6) 为增温处理(Warming)小区,白色小区(C1—C6) 为空白对照(Control)小区
1.2 样品采集与DNA提取

2012年7月,在植物生长旺盛期,分别采集增温小区和对照小区的木地肤、短花针茅、细叶葱、猪毛菜(因W6、C6小区中木地肤和猪毛菜数量极少,数据分析过程中予以剔除)。在每个小区每种植物分单株采样,选择健康无病斑的植物将嫩叶剪下,用无菌水冲洗干净后置放于2ml冻存管中,立即投放在液氮罐中备用。具体采样情况见表 2

表 2 4种生活型植物的采样情况 Table 2 Sample of four life forms plants
生活型 Plant life forms植物种 Plant species小区及个体数 Community and individual number合计 Total
小半灌木木地肤增温W1W2W3W4W5W6122
Small half shrubsKochia prostrata12151015100
对照C1C2C3C4C5C6
12131015100
多年生禾草短花针茅增温W1W2W3W4W5W6132
Perennial grassesStipa breviflora14111113145
对照C1C2C3C4C5C6
151391377
多年生杂类草细叶葱增温W1W2W3W4W5W6168
Perennial forbsAllium tenuissimum141314151414
对照C1C2C3C4C5C6
141415141314
一、二年生植物猪毛菜增温W1W2W3W4W5W6132
Annuals and biennialsSalsola collina13141213140
对照C1C2C3C4C5C6
14141311140

采用CTAB法提取基因组DNA[15]。用琼脂糖凝胶电泳检测DNA完整性,用紫外分光光度计检测DNA纯度和浓度。条带单一明亮,OD(A260/280)值在1.8—2.0之间,表明所提取的DNA纯度高,可用于AFLP的操作。将DNA浓度稀释至50ng/μL,于-20℃保存备用。

1.3 PCR扩增与数据统计

AFLP扩增参照Vos[16]等的方法。EcoR I和Mse I酶切后连接接头,进行预扩增,反应程序:94℃预变性3min; (94℃,40s; 60℃,40s; 72℃,60s) ×35循环;72℃,10min。每种植物从32对选择性扩增引物中筛选出5对信号强度一致、条带分布均匀、清晰并具有多态性的引物进行后续实验。扩增产物用8%的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测。银染后室温干燥过夜,扫描图像。AFLP条带大小从100—1500 bp,按照电泳结果中,同一迁移率上条带的有无进行统计,有条带的记为“1”,无条带的记为“0”,获得01矩阵。

1.4 数据分析

根据AFLP获得的01矩阵,分别利用POPGEN 1.31[17]软件计算4种生活型植物处理间的位点数,多态位点数,多态位点百分率(PPB),Nei′s基因多样性指数(He),Shannon′s信息指数(I),遗传一致度和遗传距离。利用NTSYS 2.1[18]软件进行非加权算术平均法(UPGMA)聚类。并利用Arlequin3.11[19]软件进行分子方差分析及等级剖分分析。

2 结果与分析 2.1 遗传多样性分析

经过POPGEN 1.32软件的计算,木地肤5对引物扩增出106个位点,其中对照小区多态性位点12个,多态位点百分率11.32%;增温小区多态性位点12个,多态位点百分率11.32%。短花针茅5对引物扩增出218个位点,其中对照小区多态性位点89个,多态位点比例40.83%;增温小区多态性位点87个,多态位点百分率39.91%。细叶葱5对引物扩增出84个位点,其中对照小区多态性位点12个,多态位点百分率14.29%;增温小区多态性位点11个,多态位点百分率13.10%。猪毛菜5对引物扩增出136个位点,其中对照小区多态性位点27个,多态位点百分率19.85%;增温小区多态性位点26个,多态位点百分率19.12%。Nei′s基因多样性指数与Shannon′s 信息指数普遍较低,4种植物对照与增温处理下的Nei′s基因多样性指数(He)分别为0.0274,0.0259(木地肤);0.0812,0.0899(短花针茅);0.0131,0.0084(细叶葱);0.0506,0.04569(猪毛菜)。Shannon′s 信息指数值(I)分别为0.0447,0.0430(木地肤);0.1354,0.14669(短花针茅);0.0267,0.0182(细叶葱);0.0811,0.07339(猪毛菜)。4种植物在增温处理和对照间的遗传差异较小(表 3)。增温处理并未对其遗传多样性产生明显影响。

表 3 4种植物的遗传多样性分析 Table 3 Genetic Diversity of four life forms plants
植物种 Plant species处理 Treatment位点数 The number of loci多态位点数 The number of polymorphic loci多态位点百分率/% The percentage of polymorphic lociNei′s基因多样性指数 Nei′s gene diversityShannon′s 信息指数 Shannon′s Information index
木地肤Kochia prostrata对照1061211.320.02740.0447
增温1061211.320.02590.0430
合计1061312.260.02680.0445
短花针茅 Stipa breviflora对照2188940.830.08120.1354
增温2188739.910.08990.1466
合计2189041.280.08630.1428
细叶葱 Allium tenuissimum对照841214.290.01310.0267
增温841113.100.00840.0182
合计841214.290.01090.0229
猪毛菜Salsola collina对照1362719.850.05060.0811
增温13626 19.120.04560.0733
合计1362820.590.05220.0834
2.2 遗传分化

遗传一致度和遗传距离代表了不同处理间的植物的亲缘关系。遗传一致度越大、遗传距离越小,则亲缘关系较近。由表 4可见木地肤、短花针茅、细叶葱和猪毛菜增温与对照之间的的遗传一致度分别为0.9999,0.9963,0.9994,0.9929;遗传距离分别为0.0001,0.0037,0.0006,0.0071。其中猪毛菜的遗传一致度最小为0.9929,遗传距离最远为0.0071。

表 4 4种植物处理间的遗传一致度和遗传距离 Table 4 Genetic identity and genetic distance among groups of four life forms plants
植物种 Plant species遗传一致度 Genetic identity遗传距离 Genetic distance植物种 Plant species遗传一致度 Genetic identity遗传距离 Genetic distance
木地肤Kochia prostrata0.99990.0001细叶葱Allium tenuissimum0.99940.0006
短花针茅Stipa breviflora0.99630.0037猪毛菜Salsola collina0.99290.0071

根据遗传一致度,利用NTSYS 2.10软件进行非加权组平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA)聚类。图 2为4种植物的不同小区间的聚类图,其中木地肤增温处理小区W4、W1、W3分别依次和对照小区的C5、C4、C3形成3个一级聚类,依次形成的二、三级及高级聚类都没有将增温和对照小区聚为大类;短花针茅虽然C1和C2、W1和W2、C3和C6这6个小区分别形成3个相同处理的一级聚类,但是在更高级的聚类中没有相同规律;细叶葱的C1和W4形成一级聚类,W2、W3和C3形成一级聚类,然后依次与C4、W6和C5形成二、三、四级聚类;猪毛菜W3和W5,C4和W4,W1和W2分别形成一级聚类,进一步的聚类也没有规律。可见4种植物并没有按照增温与对照处理的聚为不同的两支,聚类皆没有规律可循。

图 2 4种生活型植物的UPGMA聚类图 Fig. 2 Dendrogram by UPGMA analysis of four life forms plants A: 木地肤10个小区的UPGMA聚类图; B: 短花针茅12个小区的UPGMA聚类图; C: 细叶葱12个小区的UPGMA聚类图; D: 猪毛菜10个小区的UPGMA聚类图
2.3 分子方差分析

对4种植物进行AMOVA分析,结果(表 5)显示4种植物的变异主要来源于种群内。其中,木地肤种群内变异最多85.03%,细叶葱70.00%,猪毛菜次之66.52%,短花针茅最少66.35%。而4种植物来源于处理间的变异都较少分别为-2.81%(木地肤)、-5.47%(短花针茅)、-3.60%(细叶葱)、2.53%(猪毛菜)。其中木地肤、短花针茅、细叶葱的处理间的变异百分率都为负值,说明增温处理与其变异并没有相关性。而猪毛菜来源于处理间的变异占到了总变异的2.53%,虽然P值仍然大于0.05,但表明在模拟增温处理6年之后发生了一定程度上的遗传结构的变化。猪毛菜作为一年生植物,表现出与其他生活型植物不同的响应。

表 5 4种植物的AMOVA分析 Table 5 Analysis of molecular variance(AMOVA) for four life forms plants
植物种 Plant species变异来源 Source of variation自由度 Degrees of freedom变异组分 Variance component总变异百分率/% Total varianceP
木地肤Kochia prostrata处理间1-0.05898-2.810.95210
处理内种群间80.3732517.760
种群内1121.7871085.030
合计1212.10137
短花针茅Stipa breviflora处理间1-0.72446-5.470.92473
处理内种群间105.1958639.220
种群内1218.7781466.350
合计13213.24954
细叶葱Allium tenuissimum处理间1-0.03056-3.600.93541
处理内种群间100.8342733.600
种群内1560.5938670.000
合计1670.84836
猪毛菜Salsola collina处理间10.116452.530.27468
处理内种群间81.4264630.960
种群内1233.0651166.520
合计Total1324.60802

通过等级剖分(nested analysis of molecular variance)分析4种植物种群内、处理内种群间和处理间的遗传分化系数(表 6)。处理间的遗传分化都较低,其中木地肤、短花针茅、细叶葱都为负值(-0.02807、-0.05468、-0.03602) ,只有猪毛菜数为正值(0.02527) 。说明木地肤、短花针茅、细叶葱3种植物的遗传分化与增温处理之间并无相关性。而猪毛菜在增温处理之下发生了一定程度遗传变异。

表 6 4种植物的遗传分化系数 Table 6 PHI-statistics of four life forms plants
植物种 Plant species种群内遗传分化系数 PHI-statistics within populations处理内种群间遗传分化系数 PHI-statistics among populations within groups处理间遗传分化系数 PHI-statistics among groups
木地肤Kochia prostrata0.172770.14955-0.02807
短花针茅Stipa breviflora0.371820.33748-0.05468
细叶葱Allium tenuissimum0.324320.29998-0.03602
猪毛菜Salsola collina0.317590.334830.02527
3 讨论与结论

气候预测显示,未来我国气温仍将升高[3]。在野外自然条件下的生态系统增温实验成为了研究全球变暖与陆地生态系统的关键[20]。本研究所使用的红外线辐射器(Infrared radiator)可以同时影响显热、潜热和土壤热通量[21],因而有效的模拟了全球变暖的情况。

在本研究中4种生活型植物木地肤、短花针茅、细叶葱、猪毛菜的多态位点百分率分别为12.26%、41.28、14.29、20.59,Nei′s基因多样性指数分别为0.0268、0.0863、0.0109、0.0522和Shannon′s 信息指数分别为0.0445、0.1428、0.0229、0.0834,都较低,遗传多样性并不丰富。对4种生活型植物的聚类图分析也显示增温处理组与对照组并未聚为两个类群。首先,这与样地设置有关,在以往有关遗传多样性的研究中大都是以不同品种或是地理间隔较远的植物为研究目标[22-24],如在对大针茅(Stipa grandis)[25]和克氏针茅(Stipa krylovii)[26]遗传多样性的研究中,研究者在同一地点不同样本之间的采样距离也会间隔50m以上,因为以往都是研究自然种群遗传差异,由于研究目的不同,地理种群间距离较远,种群间有较高的遗传多样性(克氏针茅Nei′s基因多样性指数0. 2989,Shannon′s 信息指数0. 4014;大针茅Nei′s基因多样性指数0.3486,Shannon′s 信息指数0.2314) 而在本研究中12个小区间相隔只有3m,由于间隔近,不同小区间植物的遗传背景较一致,有的不同小区内的植株甚至可能来源于同一个母株的种子。这是种群间遗传多样性较低的直接原因。其次,由于增温处理的时间有限,6a的时间很有可能并不足以使植物种群遗传发生明显分化。在模拟增温对青藏高原草甸生态系统影响的研究中发现[27],在增温实验的前两年出现植物初级生产量大幅增加,生物多样性增加的现象,而在实验的第3年之后初级生产量开始下降,并且生物多样性也在降低。这说明在植物响应模拟增温的过程,其反应随处理时间的长短会产生不同的结果,推测短花针茅草原各种生活型植物在遗传上对增温的响应还没有出现。另外多年生植物在样地内并没有适宜的条件允许实生苗建植,即使增温处理使种子产生了某些变化,这些种子也未必能在小区内形成植株,继而无法被采集到相关遗传改变的信息;而且多年生植物对这种温和的增温处理在新芽和新生叶片生长过程中可能未受到影响。

分子方差分析是1992年由Excoffier[19]发展出来的一种进行遗传变异等级剖分的方法,并提出了与F-statistics类似的PHI-statistics等方法来有效地度量亚群体的分化。在本研究中,4种生活型植物当中的多年生植物处理间变异占总变异的百分率(Total variance)以及遗传分化系数(PHI-statistics)都为负值。这种现象在张丽[28]对中华白蛉(Phlebotomus chinensis)的研究中也曾经出现过,负值说明处理间不存在遗传分化。而一年生植物猪毛菜则表现出了不同,其处理间的遗传分化系数为0.0253,处理间的变异百分率也达到了2.53%,虽然P值仍然大于0.05,但表现出一定程度的遗传分化趋势。这4种生活型植物都是荒漠草原的典型植物,从形态结构上来看,他们都具有典型的旱生结构,可以有效的反射阳光,控制水分的蒸发[29-32]。以往的研究结果显示一年生植物对增温处理有较敏感的响应,常兆丰[33]对民勤荒漠区不同生活型植物响应气候变暖的研究中发现,草本植物的春季物候和秋季物候响应气候变暖的敏感程度都大于灌木。在杨健[34]的研究中发现,增温处理对多年生植物加拿大一枝黄花(Hemerocallis citrina)地下部分没有影响,但趋于降低一年生植物鬼针草(Bidens pilosa)对根系生物量的分配。本研究中作为一年生植物的猪毛菜很可能是因为具备了更短的生活周期,才能够在相同的时间内较早的对模拟增温作出了遗传层面上的应答。推测每次含有一些变异的种子飘落后都会在小区内参与下一年群落的形成,因而增温处理对其影响在每个世代(每年)中都有一些积累,虽然这种积累非常的微弱。这种变异在一定程度上反映了增温对植物影响的趋势。

而王迪[35]等认为,当植物遇到环境压力时,即使DNA序列水平上没有发生变化,也会发生表观遗传学上的变化,这种变化一部分是可以遗传的,一部分会因为压力的去除而在同一代细胞中发生回复。近年来表观遗传学已经越来越受到关注[36]。和传统意义上的遗传学相比,所谓的表观遗传学,就是不涉及DNA序列改变,然而最终可能影响表型变化的可遗传的现象[37]。在作者其他的研究中发现,短花针茅虽然在增温处理与未增温处理间DNA水平没有发生改变,但是在转录组水平上发现了一些基因的差异表达,表明增温影响了基因的表达,这其中不能否定有表观遗传学水平的变化,模拟增温使表观遗传的修饰程度会发生改变。自然选择是塑造和维持植物自然遗传多样性与种群遗传结构的主要动力[38]。随着全球气候变暖的趋势,植物的种群[39]、群落[40-41]、生态系统[42-45]乃至整个生物圈[46]必将发生巨大改变。而本研究发现不同的生活型植物面对这一变化产生不同的结果,一年生植物会容易受到增温影响。随着时间的推移,研究的深入,在之后的研究中将会加入对增温去除组的关注,并进行表观遗传学的研究,将对模拟增温下不同生活型植物的适应机制会有更加透彻的了解。

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